Церковь Фрауэнкирхе за свое существование пережила не мало невзгод. Ее разрушали, перестраивали, восстанавливали, сносили и реконструировали. Изначальное строение не было лютеранской церковью. Еще в XI году в Дрездене была построена церковь Богородицы. Немного позднее романское здание было расширено готическими постройками. Лишь после Реформации церковь Богородицы превратилась в лютеранскую церковь Фрауэнкирхе.

В новом виде строение прибывало вплоть до XVIII века. Но время беспощадно и церковь пришла в упадок. К тому же количество приверженцев лютеранства росло, а стены церкви не обладали свойствами резины. Поэтому возникла необходимость в перестройке здания.

Церковь была снесена под корню. На ее месте должна была вырасти новая лютеранская обитель. Спустя лишь шестнадцать лет новая церковь была полностью выстроена. Новая церковь возвышалась на 95 метров над землей, и вмещало в своих стенах три с половиной прихожан. Венчал здание огромный купол. Со стороны церковь создавала впечатление простоты, а внутри удивляло своим изысканным убранством.

После возведения новой церкви, ее несколько раз ремонтировали. Однако, Вторая мировая война не обошла церковь стороной. Во время воздушной бомбардировки Фрауэнкирхе была разрушена. На месте величественной постройки, символа лютеранства остались лишь обломки. В таком состоянии церковь прибывала долгое время. Власти было взялись за ее восстановление, но сославшись на финансовые сложности, оставили эту затею. Предпринимались попытки исследовать обломки и восстановить церковь в ее первозданном виде.

Лишь благодаря движению «Акция-Фрауэнкирхе» были собраны средства на исследование руин и восстановление церкви. Новое здание было выстроена почти на половину из оригинальных элементов. На открытие восстановленной лютеранской церкви приехал сам президент Германии.